Blant Athenas allierte var mange helter fra gresk mytologi inkludert Odysseus Jason Perseus og Herakles. Fordi hun stilte seg på grekernes side i den trojanske krigen inkluderte fiendene hennes Paris og de andre forsvarerne av Troja. Blant gudene hennes motstandere inkluderte Hefaistos og Poseidon.
I følge gresk mytologi hjalp Athena Jason med å skaffe seg den gylne fleece. Hun hjalp også Perseus med å halshugge Medusa. Hun rådet Herakles til å bruke den nemeiske løvens egne klør for å skjære gjennom dens uinntakelige skinn, ga ham en rangle for å skremme Stymphalian-fuglene slik at han kunne drepe dem og hjalp ham inn i underverdenen for å beseire Cerberus. Athena tilbød Odyssevs råd gjennom hele den trojanske krigen og beskyttet ham i hans vandring ledet ham hjem og hjalp ham med å gjenvinne hjemmet og kona.
En gresk myte forteller at Afrodite Hera og Athena alle hevdet å være den vakreste gudinnen og Zevs utnevnte Paris til en trojansk prins for å bestemme mellom dem. Paris valgte Afrodite fremfor Athena, og dette fikk Athena til å favorisere den greske siden i den trojanske krigen. Selv om både Ares og Athena var representanter for krig, symboliserte hun visdomsinnsikt mot ære og moralsk overlegenhet fremfor frykt og blodlyst. Selv om Athena er anerkjent for å være en jomfrugudinne, ble hun mor. Hefaistos, sønnen til Zevs og Hera, prøvde å voldta henne, og da frøet hans falt fra benet hennes til jorden, ble den halvslange-halvmannen Erichthonius født. Poseidon ble Athenas motstander på grunn av en krangel om hvem som skulle være skytshelgen for Athen. I sin konkurranse tilbød de athenerne gaver. Poseidon tilbød athenerne en saltvannsfontene, men Athena vant ved å tilby dem et oliventre.
