Mark Harmon tjener $525000 pluss en fortjenesteprosent for sin ledende rolle på NCIS. Pauley Perrette og Michael Weatherly tjener 175 000 dollar per episode for rollene sine i showet.
Mark Harmons kontrakt ble oppdatert til nåværende status da NCIS ble fornyet for en 11. sesong i 2013. Harmons lønn gjorde ham til den best betalte dramaskuespilleren på TV på tidspunktet for signeringen, bak Ashton Kutcher og Jon Cryer for rollene deres på Two and a Half Men. Harmon ble den best betalte skuespilleren på TV i 2015 da Two and a Half Men avsluttet sitt 12-sesongløp. I tillegg til sin fungerende lønn mottar Harmon gjenværende utbetalinger som utøvende produsent av NCIS.
